Опубликовал(а) sandworm - 21 мар 2020, 03:45
- 21 мар 2020, 03:45
#26
[email protected] ([email protected], FAH) — проект распределённых вычислений для проведения компьютерного моделирования свёртывания молекул белка. Проект запущен 1 октября 2000 года учёными из Стэнфордского университета.
Для выполнения вычислений [email protected] использует не суперкомпьютер, а вычислительную мощь сотен тысяч персональных компьютеров со всего мира. Чтобы участвовать в проекте, человек должен загрузить небольшую программу-клиент. Клиентская программа [email protected] запускается в фоновом режиме и выполняет вычисления лишь в то время, когда ресурсы процессора не полностью используются другими приложениями.
Программа-клиент [email protected] периодически подключается к серверу для получения очередной порции данных для вычислений. После завершения расчётов их результаты отсылаются обратно.
В последнее время интерес к проекту повысился из-за возникшей пандемии коронавирусной инфекции COVID-19.
[email protected] моделирует динамику белков COVID-19 для поиска новых терапевтических возможностей.
Белки — высокомолекулярные органические вещества, состоящие из альфа-аминокислот, соединённых в цепочку пептидной связью. Множество их комбинаций создают молекулы белков с большим разнообразием свойств. Кроме того, аминокислотные остатки в составе белка часто подвергаются посттрансляционным модификациям, которые могут возникать и до того, как белок начинает выполнять свою функцию, и во время его «работы» в клетке. Часто в живых организмах несколько молекул разных белков образуют сложные комплексы, например фотосинтетический комплекс.
У вирусов тоже есть белки, которые они используют для подавления нашей иммунной системы и размножения. Чтобы помочь в борьбе с коронавирусом, участники [email protected] хотят понять, как работают эти вирусные белки, чтобы остановить их.
Существует много экспериментальных методов определения белковых структур. Они показывают только один снимок обычной формы белка. Но у белков много движущихся частей, и главное увидеть белок в действии. Структуры, которые мы не видны, могут стать ключом к открытию нового терапевтического средства.
Задача проекта [email protected] заключается в использовании компьютерного моделирования для обнаружения движущихся частей белка. Взяв экспериментальные структуры за отправную точку, можно смоделировать, как движутся все атомы в белке.
Можно сделать то же самое с коронавирусом, и вы можете помочь! Загрузите [email protected] и начните оказывать помощь в проведении симуляций - основной способ внести свой вклад. Эти расчеты огромны, и каждый немного помогает! Предстоит сделать много ценных научных исследований.
Участники проекта могут видеть статистику своего вклада. Каждый участник может запустить программу-клиент на одном или более компьютерах, может вступить в одну из команд. Номер нашей команды: 242247.
Для выполнения вычислений [email protected] использует не суперкомпьютер, а вычислительную мощь сотен тысяч персональных компьютеров со всего мира. Чтобы участвовать в проекте, человек должен загрузить небольшую программу-клиент. Клиентская программа [email protected] запускается в фоновом режиме и выполняет вычисления лишь в то время, когда ресурсы процессора не полностью используются другими приложениями.
Программа-клиент [email protected] периодически подключается к серверу для получения очередной порции данных для вычислений. После завершения расчётов их результаты отсылаются обратно.
В последнее время интерес к проекту повысился из-за возникшей пандемии коронавирусной инфекции COVID-19.
[email protected] моделирует динамику белков COVID-19 для поиска новых терапевтических возможностей.
Белки — высокомолекулярные органические вещества, состоящие из альфа-аминокислот, соединённых в цепочку пептидной связью. Множество их комбинаций создают молекулы белков с большим разнообразием свойств. Кроме того, аминокислотные остатки в составе белка часто подвергаются посттрансляционным модификациям, которые могут возникать и до того, как белок начинает выполнять свою функцию, и во время его «работы» в клетке. Часто в живых организмах несколько молекул разных белков образуют сложные комплексы, например фотосинтетический комплекс.
У вирусов тоже есть белки, которые они используют для подавления нашей иммунной системы и размножения. Чтобы помочь в борьбе с коронавирусом, участники [email protected] хотят понять, как работают эти вирусные белки, чтобы остановить их.
Существует много экспериментальных методов определения белковых структур. Они показывают только один снимок обычной формы белка. Но у белков много движущихся частей, и главное увидеть белок в действии. Структуры, которые мы не видны, могут стать ключом к открытию нового терапевтического средства.
Задача проекта [email protected] заключается в использовании компьютерного моделирования для обнаружения движущихся частей белка. Взяв экспериментальные структуры за отправную точку, можно смоделировать, как движутся все атомы в белке.
Можно сделать то же самое с коронавирусом, и вы можете помочь! Загрузите [email protected] и начните оказывать помощь в проведении симуляций - основной способ внести свой вклад. Эти расчеты огромны, и каждый немного помогает! Предстоит сделать много ценных научных исследований.
Участники проекта могут видеть статистику своего вклада. Каждый участник может запустить программу-клиент на одном или более компьютерах, может вступить в одну из команд. Номер нашей команды: 242247.
- strider